Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPIAP49247 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms