Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms