Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.2 ms