Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CHRNA7P36544 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms