Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms