Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms