Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR1P32246 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR1P32246 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR1P32246 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR1P32246 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCR1P32246 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCR1P32246 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCR1P32246 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCR1P32246 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCR1P32246 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCR1P32246 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCR1P32246 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms