Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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