Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms