Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TSPOP30536 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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