Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMBRP28336 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMBRP28336 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMBRP28336 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMBRP28336 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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