Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRCP23327 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRCP23327 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRCP23327 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRCP23327 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms