Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms