Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT1P21579 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT1P21579 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms