Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms