Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CXCL2P19875 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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CXCL2P19875 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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CXCL2P19875 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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CXCL2P19875 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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