Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms