Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGB4P16144 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms