Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms