Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms