Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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