Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE8BO95263 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE8BO95263 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms