Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP104O60308 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP104O60308 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP104O60308 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP104O60308 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP104O60308 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms