Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUX2O14529 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUX2O14529 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUX2O14529 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUX2O14529 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms