Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRPO00253 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRPO00253 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGRPO00253 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
AGRPO00253 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGRPO00253 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGRPO00253 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGRPO00253 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGRPO00253 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms