Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms