Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms