Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SERINC4A6NH21 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC4A6NH21 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms