Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
A4D1N5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
A4D1N5 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
A4D1N5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
A4D1N5 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
A4D1N5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
A4D1N5 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
A4D1N5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms