Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms