Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF24Q9UPV7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF24Q9UPV7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms