Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGAP1Q9UPQ3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms