Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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