Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms