Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms