Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms