Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMC3IPQ9P2W1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms