Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms