Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms