Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FANCFQ9NPI8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FANCFQ9NPI8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FANCFQ9NPI8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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FANCFQ9NPI8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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