Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms