Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM12Q9H4Q4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms