Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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