Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms