Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LNPKQ9C0E8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms