Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDAC8Q9BY41 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC8Q9BY41 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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