Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms