Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms