Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms