Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms